手机游戏《魔法禁书目录》是由网易游戏制作的3D日式角色扮演手游。作品根据同名轻小说改编，由《魔法禁书目录》《科学超电磁炮》动画委员会授权，广州天闻角川动漫有限公司代理，日本角川集团监修。

游戏分别于2017年8月31日、9月7日起在iOS、Android系统的各平台公开测试。

游戏中，玩家们将会成为“适格者”，穿越到学园都市体验原著剧情。作品对原著的剧情、经典战斗、经典台词和角色间人际关系进行还原，描绘了魔法与科学交织的世界。

游戏于2017年11月24日起与《闪乱神乐 ESTIVAL VERSUS -少女们的选择-》联动  ；2018年1月12日至2018年2月9日与《伊苏Ⅷ：达娜的安魂曲》联动 ；2018年8月24日至2018年9月23日与《樱花大战》联动  。

学园都市由统括理事会会长亚雷斯塔·克劳利花费数十年建立，主要由大大小小的学校和研究机构构成，八成的居民都是学生。学园都市拥有世界上最尖端的科技，是科学阵营的领导者，在学园都市中拥有世界最强的超高度并列演算电脑“树形图设计者”监视学生们的一举一动。学生们通过接受能力开发可以获得超能力，不乏有战斗力超强的角色。

茵蒂克丝拥有完全记忆能力，脑袋里装有十万三千本魔导书，为了防止茵蒂克丝与他人太过亲近，教会每隔一年就会清除她的记忆。故事开始一年前，茵蒂克丝刚刚被清除记忆，已经失去记忆的她不认得身边的史提尔·马格努斯和神裂火织，反而以为两人是来夺取自己脑内存储的魔导书的，因此开始逃亡，在途中失足跌落，挂在了上条当麻宿舍的阳台上。

暑假的一天，当一位“无能力者”的少年，在自家阳台遇上从天而降，掌握十万三千本究极魔法书的少女，故事就从这里开始了。